基于转录组序列的夏蜡梅SSR位点特征与引物开发
2017-08-20分类号：S685.99
【部门】浙江农林大学风景园林与建筑学院
【摘要】夏蜡梅Sinocalycanthus chinensis是中国二级濒危植物。为了开发基于夏蜡梅转录组序列的表达序列标签SSR(EST-SSRs)引物,从夏蜡梅转录组数据库组装的125 014条unigene序列中检测到26 564个简单重复序列(SSRs),平均密度为5.18 kb,最丰富的类型是2碱基重复、单碱基重复和3碱基重复,分别占总SSRs的42.43%,29.50%和23.25%,其中主导类型是(AG/CT)_n。利用L_(16)(45)正交试验获得夏蜡梅的最优简单重复序列-聚合酶链式反应(SS
【关键词】植物学 夏蜡梅 ESR-SSR 引物筛选 扩增体系 正交实验
【基金】国家自然科学基金资助项目(31401902,31101571)
【所属期刊栏目】浙江农林大学学报
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