菠萝EST资源的SSR信息分析与开发
2017-03-21分类号：S668.3
【部门】浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地 新疆农业大学农学院
【摘要】表达序列标签-简单重复序列(EST-SSRs)存在于表达序列标签中,是一种最常用的新型微卫星标记。它可以被嵌入到功能基因序列中,有效并高效地提供更多的相关信息。通过对已公开的5 659条菠萝Ananas comosus的表达序列标签(ESTs)进行电子筛选,获得了617条含有简单重复序列(SSR)的菠萝EST。平均7.39 kb EST序列中含有1个SSR,其中二核苷酸,三核苷酸和六核苷酸是SSR的主要重复类型,分别占SSR总数的42.61%,29.25%和20.13%。所有重复类型中重复次数最少的是四核
【关键词】分子生物学 菠萝 表达序列标签 简单重复序列
【基金】浙江省自然科学基金资助项目(LY14C160009)
【所属期刊栏目】浙江农林大学学报
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