刺参(Apostichopusjaponicus)重要经济性状相关SNP标记的验证分析
2018-03-07分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学 中国水产科学究院黄海水产研究所 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 青岛瑞滋海珍品发展有限公司
【摘要】本研究在前期构建的刺参高密度遗传连锁图谱和QTL分析的基础上,筛选出26个与体长、体重、体宽、棘刺总数、抗病力相关的SNP位点,设计出可用于HRM检测的SNP扩增引物13对。在扩大群体中利用HRM小片段法对这13个刺参重要经济性状相关的候选SNP位点进行分型和多态性检测并结合扩大群体的相关性状数据进行了QTL位点验证。多态性结果表明13个位点中有3个单态性位点,剩下的10个多态性位点中有3个位点为低等位多态性,7个位点为中等位多态性。10个多态性位点的最小等位基因频率(MAF)介于0.016(SNP113
【关键词】刺参 QTL位点 SNP 高分辨率熔解曲线 验证
【基金】中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费(20603022016008);; 山东省农业良种工程重大课题(2017LZGC010)共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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