牙鲆tyrp1a和tyrp1b的鉴定及tyrp1a与mmu-miR-143-5p_R+2的调控关系
2018-01-19分类号:S917.4
【部门】农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所 上海海洋大学水产与生命学院 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
【摘要】为了研究牙鲆白化发生过程中的分子调控机制,本研究在获得正常和白化牙鲆转录组及micro RNA(miRNA)深度测序数据的基础上,对tyrosinase related protein 1(Tyrp1)和mmu-miR-143-5p_R+2(mmu-143)进行了表达模式、靶基因预测及验证分析。首先通过RACE方法克隆得到白化相关基因Tyrp1的2个转录本,进化树分析表明这2个转录本分别是Tyrp1a和Tyrp1b,利用RNAhybrid软件预测到mmu-143可能与Tyrp1a基因存在互作关系,通过双荧
【关键词】牙鲆 白化 mmu-mi R-143-5p_R+2 tyrp1a tyrp1b
【基金】国家自然科学基金项目(31472273);; 山东省泰山学者攀登计划项目共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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