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毛果杨CBF/DREB1基因家族生物信息学分析

2018-03-30分类号:S792.11

【作者】丁咚  陈亚娟  崔进荣  魏建华  张玉红  张杰伟  
【部门】东北林业大学森林植物生态学教育部重点实验室  北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心农业基因资源与生物技术北京市重点实验室  
【摘要】【目的】为了对毛果杨CBF基因家族进行系统分析,利用毛果杨基因组数据库,通过生物信息学的方法,鉴定毛果杨CBF基因家族的染色体定位、编码蛋白和磷酸化位点预测。【方法】通过序列比对进行进化和分类分析。【结果】毛果杨含有6个CBF基因,均不含内显子,分布于毛果杨的5条染色体上。【结论】MEME保守基序分析显示,杨树CBF蛋白均含有2个保守的基序,他们共同构成AP2结构域。磷酸化位点预测分析表明毛果杨CBF蛋白均含有大量的磷酸化位点。以上结果将为今后揭示毛果杨CBF蛋白的功能提供重要的线索。
【关键词】杨树  CBF/DREB1  基因家族  进化分析
【基金】国家“863”项目(2013AA102702);; 国家自然科学基金(31270593);; 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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