水淹胁迫下三峡库区消落带适生狗牙根转录因子的转录组分析
2018-03-16分类号：Q945.78
【部门】重庆三峡学院生命科学与工程学院 重庆大学生命科学学院重庆市基因功能与调控重点实验室
【摘要】【目的】从转录水平整体分析狗牙根在水淹生境下的基因表达模式对探索植物的抗水淹机制具有重要意义。【方法】本研究通过转录组测序研究了水淹(处理组)和非水淹(对照组)生境下的三峡库区消落带适生狗牙根的转录因子(transcription factor,TF)基因表达变化。【结果】测序数据经拼接共获得147 256条非冗余Unigenes,经Nr、Nt、Swissprot、KEGG、COG、Interpro和GO数据库可注释72.84%的Unigene;筛选到与狗牙根响应水淹胁迫有关的54个家族的785条差异表达
【关键词】狗牙根 水淹胁迫 转录组分析 TF 差异表达基因
【基金】重庆市教委科学技术研究项目(KJ1401001);重庆市教委科学技术研究项目(KJ1501011);; 重庆市自然科学基金(cstc2016jcyj A2135);重庆市自然科学基金(cstc2016jcyj A2132);; 渝东北特色生物资源开发利用工程中心资助
【所属期刊栏目】西南农业学报
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