雨生红球藻PHOT的基因克隆和生物信息学分析
2018-01-11分类号:Q943.2
【部门】大连大学生命科学与技术学院 中国科学院烟台海岸带研究所海岸带生物学与生物资源利用重点实验室 中国科学院大学 深圳大学生命与海洋科学学院
【摘要】【目的】本文旨在获得雨生红球藻中蓝光受体向光素(Phototropin,PHOT)的全长序列并进行生物信息分析。【方法】采用同源克隆和RACE结合的方法获得雨生红球藻中编码HaePHOT的c DNA序列全长,并对HaePHOT进行生物信息分析。【结果】HaePHOT的开放阅读框全长为2139 bp,编码712个氨基酸,预测的等电点8.66,理论分子量78.73 k D。经BLASTP程序分析,与拟南芥来源PHOT的相似性达到58%,与莱茵衣藻来源PHOT的相似性达到68%。通过序列比对和结构域分析,PHO
【关键词】向光素 cDNA全长 结构域 系统进化 雨生红球藻
【基金】国家级大学生创新创业训练计划项目(201611258038);; 国家自然基金项目(41376139)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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