橡胶树PEPC基因的克隆、生物信息学和表达分析
2017-12-05分类号:S794.1
【部门】中国热带农业科学院橡胶研究所∕农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室
【摘要】【目的】克隆橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的全长cDNA,通过生物信息学和基因表达分析,为基因功能研究奠定基础。【方法】根据橡胶树PEPC基因片段序列设计引物,通过RACE获得cDNA全长,用DNAMAN软件预测编码多肽序列,用Prot Param工具分析多肽基本理化性质,用NCBI-Blast工具搜索同源的核酸及多肽序列,用Clustal X2.0软件比对不同植物来源的多肽序列,并用MEGA 6.06软件构建系统进化树,用Real-time RT-PCR分析基因表达模式。【结果】从橡胶树胶
【关键词】橡胶树 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因 克隆 生物信息学 基因表达
【基金】中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630022012011,1630022017023)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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