兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析
2017-11-10分类号:S682.31
【部门】北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室
【摘要】【目的】为研究兰花(Phalaenopsis equestris)中PI-PLC基因家族各成员在兰花中的生理功能。【方法】利用兰花基因组数据库,经过生物信息学分析,获得兰花PI-PLC基因家族成员的基因结构、染色体定位和编码蛋白,经过多重序列比对进行进化和分类分析。【结果】结果表明:兰花基因组中含有3个PI-PLC家族基因成员,分别含有913个外显子。TMHMM跨膜区结构分析显示,兰花PI-PLC蛋白均不含有跨膜区;MEME保守结构域分析显示,兰花PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域。
【关键词】磷酸肌醇特异性磷脂酶C 兰花 基因家族 进化分析
【基金】北京市科技计划(Z171100001517011);; 北京市农林科学院青年科研基金项目(QNJJ201416);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20170203)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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