玫瑰根系AMF 18S rRNA基因克隆文库构建及分析
2017-09-27分类号：Q943.2;S685.12
【部门】昆明学院农学院/云南省高等学校都市型现代农业工程研究中心 云南大学医学院
【摘要】【目的】本文研究了玫瑰根系的AMF多样性和组成结构。【方法】从昆明学院种质资源圃随机采集玫瑰‘卡罗拉’3株,采用CTAB法提取根系DNA,运用巢式PCR扩增AM真菌部分18S rRNA基因区域,扩增产物混合后构建克隆文库,最终确定30个阳性克隆子测序,并对文库进行评价和分析。【结果】文库Coverage C值为80%,但Rarefaction曲线不够饱和,应加大文库克隆子数目;文库多样性参数香农指数和辛普森指数分别为1.432和0.25,物种丰富度为4.0;以98%为界,30条序列被划分为15个OTU,均
【关键词】玫瑰‘卡罗拉’ 丛枝菌根真菌 克隆文库 系统发育树 评价和分析
【基金】云南省应用基础研究自筹基金项目(2013FZ099);; 云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目;; 昆明学院人才引进基金项目(YJL12002);昆明学院校级科学研究一般项目(XJL14018);; 云南省高校特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金项目(GXKJ201623)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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