基于高通量测序分析大花杓兰根际土壤细菌多样性
2017-05-03分类号：S154.3;S682.31
【部门】廊坊职业技术学院 廊坊师范学院生命科学学院 河北省高校食药用菌应用技术研发中心 廊坊市食用菌技术重点实验室
【摘要】【目的】从分子水平上对珍稀濒危药用植物大花杓兰根际土壤细菌群落多样性进行初步探讨。【方法】通过Illumina Miseq高通量测序技术对大花杓兰根际土壤细菌16S rRNA基因的V3V4高变区片段进行测序,而后进行生物信息学分析。【结果】共得到166,847条16S rRNA基因序列。基于≥97%的相似度水平,通过聚类共获得1549个可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)。大花杓兰根际土壤细菌在门、纲、目、科和属分类水平上的优势类群分别为变形菌门Proteob
【关键词】大花杓兰 根际细菌 细菌多样性 高通量测序
【基金】河北省教育厅青年拔尖人才项目(BJ2016045);; 廊坊师范学院博士基金项目(LSLB201405);廊坊师范学院微生物学重点学科项目(2015001);; 廊坊师范人才引进科研启动项目(0140102001)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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