桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析
2017-03-31分类号：S662.1
【部门】北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室 中国科学院大学
【摘要】为了研究桃钙调磷酸酶B类似蛋白(CBLs)基因家族在桃中如何发挥作用。利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CBL家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃基因组中含有8个CBL家族基因,分布于桃的5条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CBL蛋白均含有4个保守的EF结构域。进化树分析表明CBLs可分为4个亚家族。TMHMM 2.0Server分析显示仅PpCBL1含有1个跨膜区。PlantsPFeatureScan分析显示PpCBL2、3
【关键词】钙调磷酸酶B类似蛋白 桃 基因家族 进化分析 序列特征
【基金】北京市农林科学院青年科研基金项目(QNJJ201416);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202);; 北京市科技计划(Z151100001015005)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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