【摘要】文章采用Bootstrap-DEA方法测算了2005—2015年我国31个省市高校科研活动效率,分区域对高校科研效率进行了对比研究。结果表明:从统计检验结果来看,Bootstrap-DEA测算结果相比传统DEA更加可靠;从区域之间对比来看,省域高校科研效率之间存在区域差异。高校科研效率呈现东、中、西部阶梯式下降的趋势;2005—2015年我国中部、西部高校科研效率呈现递减趋势,东部地区则无显著变化。