基于长片段PCR扩增的牡蛎疱疹病毒基因组高通量测序
2018-02-08分类号：S944.43
【部门】上海海洋大学水产与生命学院 中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室农业部海水养殖病害防治重点实验室青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室
【摘要】为获取2001年低温冻存栉孔扇贝感染牡蛎疱疹病毒(Os HV-1)变异株(ZK2001)基因组序列,并分析ZK2001与其他Os HV-1变异株的序列差异和系统发育关系,利用基于长片段PCR的基因组DNA的扩增和富集技术,获取2001年栉孔扇贝感染Os HV-1变异株的基因组DNA;再使用Illumina Hiseq 2500 PE250高通量测序平台对其测序。最后分析ZK2001与Os HV-1其他变异株基因组的序列差异和系统发育关系。测序数据组装后获得8个Scaffold。基因组变异分析结果显示,ZK
【关键词】栉孔扇贝 高通量测序 长片段PCR 牡蛎疱疹病毒
【基金】国家自然科学基金(31502208,31302233);; 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-48);; 青岛海洋科学与技术国家实验室鳌山科技创新计划(2015ASKJ02)
【所属期刊栏目】水产学报
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