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实时荧光定量PCR扩增特异性vapA基因检测杀鲑气单胞菌

2017-10-21分类号:S943

【作者】刘帅  王荻  卢彤岩  曹永生  杨晨  朱国建  李绍戊  
【部门】中国水产科学研究院黑龙江水产研究所  上海海洋大学水产与生命学院  新疆额尔齐斯河流域开发工程建设管理局  
【摘要】为实现杀鲑气单胞菌早期快速准确定量检测,研究旨在建立杀鲑气单胞菌的SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测方法。根据GenBank中杀鲑气单胞菌毒力阵列蛋白基因(vapA)保守序列设计并合成一对特异性引物,对其特异性、灵敏度、可重复性和应用性进行评价。结果显示,研究设计的引物具有良好的种间特异性,仅对杀鲑气单胞菌及其亚种有阳性扩增,与其他细菌不发生交叉反应。构建的Real-time PCR标准曲线质粒拷贝数与循环阈值呈良好的线性关系,扩增所得标准曲线分别为y=–4.83
【关键词】虹鳟  杀鲑气单胞菌  vapA基因  实时荧光定量PCR
【基金】中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(HSY201503);; 新疆维吾尔自治区区域协同创新专项(2016E02052)
【所属期刊栏目】水产学报
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