三疣梭子蟹线粒体基因组单核苷酸多态性
2017-12-12分类号：S917.4
【部门】淮海工学院海洋生命与水产学院江苏省海洋生物技术重点实验室 江苏省海洋生物产业技术协同创新中心 江苏省农业种质资源保护与利用平台
【摘要】为获得三疣梭子蟹线粒体全基因组(mt DNA)SNP突变位点,本研究针对其mt DNA全序列设计了179对引物,采用高分辨率熔解曲线(HRM)检测技术对SNP进行了筛查。在179对引物中,有89对引物具有特异性扩增结果;进一步研究表明,89对引物中共有22对引物的扩增区域含有SNP突变位点,共包含24个SNPs。统计结果显示,三疣梭子蟹线粒体基因组中的SNP分布频率为0.15/100 bp,其中转换突变比例为79.1%、颠换突变比例为16.6%;C/T(G/A)突变比率为79.1%、G/T(C/A)突变比
【关键词】三疣梭子蟹 线粒体基因组 SNP 高分辨率熔解曲线
【基金】国家自然科学基金(31472282);; 江苏省高校自然科学研究重大项目(13KJA240001);; 江苏省“六大人才高峰”创新人才团队专项(2016-HYGC-CXTD-004)
【所属期刊栏目】水产学报
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