转录组测序研究三角帆蚌珍珠颜色相关基因
2017-12-07分类号:S917.4
【部门】浙江师范大学化学与生命科学学院 浙江省野生动物生物技术与保护利用重点实验室 浙江师范大学行知学院
【摘要】为筛选影响三角帆蚌珍珠颜色的候选基因,采用转录组测序平台Illumina Hi Seq TM2500对蚌壳珍珠层颜色为紫色和白色的三角帆蚌中央膜组织进行高通量测序。所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、COG、KOG、KEGG、GO和Pfam数据库中注释,并进行差异基因聚类分析。结果显示,获得干净数据共72 800 581 bp,拼接获得了89 529个Unigene,差异表达基因2644个,其中上调表达基因1323个,下调表达基因1321个。根据GO功能分类可分为分子功能、细胞组分、生
【关键词】三角帆蚌 珍珠颜色 差异表达 转录组测序
【基金】浙江省十二五水产育种专项(2012C12907-9;2012C12907-5)
【所属期刊栏目】水产学报
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