番茄HSP20基因家族的全基因组鉴定、系统进化及表达分析
2017-04-15分类号:S641.2
【部门】沈阳农业大学园艺学院/设施园艺省部共建教育部重点实验室/辽宁省设施园艺重点实验室
【摘要】热激蛋白是从细菌到高等真核生物中普遍存在的一种在受到环境胁迫的响应后迅速合成的蛋白。因为小分子热激蛋白的分子量普遍在20k Da左右,故称为HSP20。借助番茄基因组数据库,利用生物信息学方法对HSP20基因家族进行鉴定及分析,结果表明,番茄中至少含有43个HSP20基因,不均匀的分布在番茄的12条染色体上。通过对茄科植物番茄、辣椒、马铃薯HSP20进行系统进化分析发现,三者存在同源关系。对HSP20基因启动子序列分析发现多个响应植物糖代谢和逆境胁迫的顺式作用元件,包括SURE、W-box等。基于RNA-
【关键词】番茄 HSP20 生物信息学 系统发育 表达分析
【基金】国家自然科学基金项目(31672138)
【所属期刊栏目】沈阳农业大学学报
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