鲚属单核苷酸多态性位点(SNPs)标记开发及在物种界定中的应用初探
2017-01-15分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
【摘要】单核苷酸多态性(SNP)分子标记结合二代测序技术是研究群体遗传学强有力的工具,同时也是界定物种的最佳方法之一。与以往获取SNPs数据的常用方法相比,靶基因富集的方法可以用来富集不同物种的同源片段,甚至可以用于部分降解的DNA。本研究应用一套通用的脊椎动物单拷贝核基因标记,通过基因富集和Illumina测序获取鲱形目鲚属数千个SNPs位点。样本取自靠近长江入海口的沿海地区、长江干流和洞庭湖。用STRUCTURE和Bayes factor delimitation(*with genomic data,BFD
【关键词】靶基因富集 基因标记 物种界定 SNP位点 BFD* 鲚属
【基金】上海市教育委员会科研创新项目资助(B2-5308-13-0455)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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