基于RNA-Seq的拟南芥不定芽再生过程的基因表达谱分析
2018-01-18分类号:Q943.2
【部门】南京农业大学生命科学学院 南京农业大学园艺学院
【摘要】[目的]本研究旨在分析拟南芥愈伤组织形成和不定芽再生2个阶段基因的差异表达情况,探究不定芽再生背后的相关基因调控机制。[方法]采用拟南芥不定芽再生两步培养法培养根外植体,利用RNA-Seq高通量测序技术分别对愈伤组织诱导培养基(CIM)培养0 d根外植体(C0)、CIM培养4 d根外植体(C4)、芽诱导培养基(SIM)培养3 d根外植体(S3)进行基因测序,利用软件分析基因表达情况。[结果]将C4的基因表达量和C0进行比对,共检测到4 332个差异表达基因,其中1 399个基因表达上调,2 933个基因表
【关键词】拟南芥 不定芽再生 两步培养法 RNA-Seq 基因表达 植物激素
【基金】国家自然科学基金项目(31400269)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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