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家鸽粪便细菌多样性的高通量测序分析及其环境意义

2017-01-30分类号:S836;S852.6

【作者】李传海  尚健  聂文芳  李立峰  曹慧  
【部门】南京农业大学生命科学学院/农业部农业环境微生物工程重点实验室  宣城市种植业局  
【摘要】[目的]研究家鸽粪便细菌群落组成与结构特征,明确鸽粪中病原微生物主要类群,探究鸽粪微生物多样性与环境风险之间的关系。[方法]以规模化养殖场家鸽粪便为试验材料,采用Illumina Mi Seq高通量测序方法分析了3个养殖场鸽粪(HP、WB和HH)细菌16S rDNA(V3V4)多样性及其环境意义。[结果]3个鸽粪样品共获得大约12万条有效序列,在Cutoff值为0.03水平上进行可操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)归类,HP、WB、HH分别有4 215、3 672
【关键词】鸽粪  高通量测序  细菌多样性  致病性细菌
【基金】国家自然科学基金项目(41371262,40871125)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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