穗花杉的转录组测序及其转录组特性分析
2017-10-15分类号：Q943.2;S791
【部门】中国林业科学研究院林业研究所 广西桂林小庐山生态农业发展有限公司
【摘要】[目的]通过对红豆杉科穗花杉属的穗花杉进行转录组测序,为穗花杉的萜类合成途径和分类学研究提供支持。[方法]利用Hi Seq2500技术对穗花杉的茎叶进行转录组测序。[结果]穗花杉转录组测序共得到8.14 Gb的clean data。从头组装共获得82 884条unigene,其中有27 495条unigene被注释。此外,在82 884条unigene中共搜索到2 827个SSR位点,单核苷酸重复SSR出现频率最高(60.1%),其次为三核苷酸重复SSR(25.4%)。在穗花杉unigene中挖掘出了1个
【关键词】穗花杉 转录组 SSR 萜类合成基因 分类
【基金】国家重点研发计划“极小种群野生植物就地保护及生境恢复技术研究与示范”课题(2016YFC0503103)
【所属期刊栏目】林业科学研究
文献传递
