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滇东南濒危植物长梗杜鹃转录组微卫星特征分析

2017-08-15分类号:S685.21

【作者】李太强  刘雄芳  万友名  李正红  李钰莹  刘秀贤  马宏  
【部门】中国林业科学研究院资源昆虫研究所  
【摘要】[目的]全面了解滇东南特有濒危植物长梗杜鹃转录组SSR位点的分布及序列特征,为长梗杜鹃的保护和合理开发利用提供遗传学资料,为同属植物及近缘种SSR标记的开发及遗传研究提供便利。[方法]利用Illumina Hiseq 4000高通量测序平台对长梗杜鹃叶片进行转录组测序,再通过MISA软件对测序所得Unigenes进行SSR位点的发掘和分析。[结果]发现含SSR的序列17 354条,共得到23 192个SSR,出现频率为31.30%,平均每3 kb出现1个SSR。二碱基和三碱基重复为长梗杜鹃SSR主要重复单
【关键词】长梗杜鹃  转录组  微卫星特征  潜在多态性
【基金】“云南省技术创新人才”培养对象项目(2016HB007)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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