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桉树焦枯病菌ABC转运蛋白的鉴定与分析

2017-08-15分类号:S763.7

【作者】刘宏毅  陈全助  叶小真  陈慧洁  李慧敏  冯丽贞  
【部门】福建农林大学林学院  福建农林大学金山学院  
【摘要】[目的]利用生物信息学方法探讨ABC转运蛋白在焦枯病菌对桉树侵染过程中的解毒作用,为揭示桉树焦枯病致病机制奠定基础。[方法]本文利用BLAST、HMMER、Pfam数据库、TCDB数据库在全基因组内对桉树焦枯病菌的ABC转运蛋白进行鉴定和分类,并通过Prot Camp和IBS分别进行亚细胞定位和结构域图绘制,依据同源性对其功能进行推测分析。[结果]表明:桉树焦枯病菌共有70个ABC转运蛋白,它们分属于8个亚族。71%的转运蛋白位于细胞膜,10%位于液泡,其余部分位于线粒体、过氧化物酶体、内质网等内膜系统上
【关键词】桉树  焦枯病菌  ABC转运蛋白  结构域  亚细胞定位
【基金】福建省财政厅项目(K81150002、K81139238、K8112004A)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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