基于沙棘转录组序列开发EST-SSR分子标记
2017-02-15分类号：S793.6
【部门】国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所 南京林业大学南方现代林业协调创新中心
【摘要】[目的]本研究通过对蒙古沙棘"向阳"品种的转录组序列进行SSR引物开发,为沙棘亲本分析、遗传多样性和遗传育种等研究提供支持。[方法]利用已测得的转录组序列进行分析和筛选,整理具有SSR位点的序列,进行引物设计,随机挑选179条引物进行验证。[结果]得到具有SSR位点的EST序列17 383条,其中,单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复基元分别占62.77%、21.82%和13.77%;二核苷酸重复基元类型以AT和AG为主,三核苷酸重复基元类型以AAG、ATC和ATA为主。9 291条序列设计出扩增EST-SS
【关键词】沙棘 转录组 EST-SSR 引物
【基金】林业公益性行业科研专项(201504103)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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