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基于随机森林算法和SRAP分子标记的桂花品种鉴定方法

2018-01-15分类号:S685.13

【作者】邱帅  沈柏春  李婷婷  郭娟  王霁  孙丽娜  陈徐平  胡绍庆  
【部门】杭州市园林绿化股份有限公司  浙江省林业科学研究院  浙江理工大学  
【摘要】【目的】为了解决桂花品种难以鉴定以及苗木生产和园林应用中品种混杂、以次充好和常规DNA指纹图谱无法很好地应用于品种鉴定的问题,提出一种基于随机森林算法和SRAP分子标记的桂花品种鉴定方法,以实现桂花品种简便、快速和准确的鉴定。【方法】以45个桂花品种或变异类型为材料,提取DNA,使用90对SRAP引物进行PCR扩增,以毛细管电泳技术采集扩增信息,筛选出多态性强、扩增结果稳定的引物,计算单对引物的多态信息含量(PIC)、带型数、有效带型数、分辨能力(D)、带型分布的卡方值(χ2)和无法区分的样品对数(x)。
【关键词】桂花  品种鉴定  分类模型  SRAP分子标记  随机森林算法
【基金】浙江省农业新品种选育重大科技专项项目(2016C02056-12)
【所属期刊栏目】林业科学
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