水稻纹枯病菌谷胱甘肽S-转移酶基因的生物信息学及表达分析
2018-02-28分类号:S435.111.42
【部门】华南农业大学农学院植物病理学系广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室
【摘要】通过生物信息学方法及表达分析对水稻纹枯病菌谷胱甘肽S转移酶基因(Rsgst)的功能进行探索。通过水稻纹枯病菌RSIADB基因组数据库查找Rsgst序列,确定该基因在水稻纹枯病菌基因组中的精确位置。利用生物信息学软件预测Rsgst编码蛋白氨基酸序列的基本信息,并使用MEGA 5.0软件构建同源蛋白的系统发育树,最后用qRT-PCR检测Rsgst在菌核发育过程中的基因表达量,同时测定GST的酶活性。结果表明,Rsgst全长1 207 bp,该基因共编码277个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为30.90 ku,理
【关键词】水稻纹枯病菌 谷胱甘肽S-转移酶 菌核发育 酶活测定 基因组定位
【基金】广东省自然科学基金(博士启动)项目(2016A030310454);; 国家自然科学基金项目(31271994)
【所属期刊栏目】华北农学报
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