水稻耐盐性QTL的meta分析及候选基因发掘
2017-12-28分类号:S511
【部门】东北农业大学水稻研究所
【摘要】为了获得真实有效的水稻耐盐性QTL信息,并缩小QTL的置信区间以及预测区间内的候选基因。以水稻6个遗传图谱的整合结果为公共图谱,并收集344个与水稻耐盐性相关的QTL。利用Bio Mercator V4.2,在图谱整合的基础上,对一致性QTL区间的注释基因进行生物信息学分析。结果表明:共检测到46个和水稻耐盐性相关的一致性QTL,对其中8个物理距离在0.5 Mb附近的一致性QTL区间进行了物理图谱定位和候选基因分析,共有1 489个预测基因被检测到,参与了细胞合成、催化活性、水解酶活性和新陈代谢等主要功能
【关键词】水稻 耐盐性状 元分析 候选基因
【基金】国家自然科学基金项目(31601377);; 黑龙江省重大科技招标基金项目(GA14B102-02)
【所属期刊栏目】华北农学报
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