小桐子HXT基因家族的全基因组鉴定及表达分析
2017-10-28分类号:Q943.2;S794.9
【部门】曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心生物资源与食品工程学院 曲靖师范学院云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室
【摘要】为了进一步理解己糖转运蛋白基因家族的结构特征以及其在植物逆境信号转导过程中的作用,基于小桐子基因组数据,鉴定到15个小桐子己糖转运蛋白基因,并对其基因结构、进化关系、密码子偏性及低温表达特性进行了分析。结果表明,15个小桐子HXT基因聚类为5个亚组,包含25个外显子,且在基因上游调控区包含ABA、乙烯、干旱及低温等逆境响应元件。编码蛋白质都富含疏水性氨基酸,具有典型的12个α-螺旋跨膜区。另外,部分小桐子HXT基因存在交叉共线性关系及基因倍增现象,且密码子的第3位碱基偏好使用U或A。荧光定量分析显示,Jc
【关键词】小桐子 己糖转运蛋白 己糖信号 基因组 表达分析
【基金】国家自然科学基金项目(31460179)
【所属期刊栏目】华北农学报
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