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马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析

2017-10-28分类号:Q943.2;S532

【作者】理向阳  代丹丹  杨铁钢  郝西  
【部门】河南省农业科学院经济作物研究所  
【摘要】为了分析马铃薯扩展蛋白基因家族的进化与功能,鉴定了马铃薯的扩展蛋白基因家族,分析了其基因结构特征、系统发育及表达模式等。结果表明,马铃薯基因组包含33个扩展蛋白基因,包括A(21)、B(5)、LA(1)和LB(6)4个亚家族,分布在马铃薯11条染色体上。扩展蛋白氨基酸长度为194488 aa,编码蛋白质具有保守的结构域,蛋白质亚细胞定位预测结果表明所有蛋白均定位于细胞外。基因结构分析表明,马铃薯扩展蛋白家族有23个基因(69.7%)含有23个内含子。基因表达分析发现,该家族基因在马铃薯根、茎、匍匐茎、果实
【关键词】马铃薯  扩展蛋白  生物信息学  基因家族
【基金】河南省农业科学院自主创新项目(2016ZZ20)
【所属期刊栏目】华北农学报
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