基于花椒转录组序列SSR分子标记开发及花椒种质鉴定
2017-10-28分类号：Q943.2;S573.9
【部门】西北农林科技大学 河南林业职业学院
【摘要】为拓展分子标记在花椒种质资源分析中的应用、开发花椒EST-SSR功能性分子标记、分析花椒DNA指纹图谱,利用凤县大红袍花椒的茎尖节点转录组c DNA数据库中45 057条长度大于200 bp的非冗余Unigene序列,使用MIcro SAtellite(MISA)软件搜索SSR位点,分析花椒c DNA序列中SSR位点的频率和密度、SSR重复基元种类及比例、SSR重复次数与数量等分布特征;用Primer 3.0软件在线设计SSR引物并经PCR扩增筛选适合的多态性引物;用Quantity One软件统计多态性
【关键词】花椒 EST-SSR 引物开发 指纹图谱
【基金】国家林业局林业公益性行业科研专项(201304706);; 西北农林科技大学产业技术集成与示范推广(TGZX 2016-08);西北农林科技大学试验示范站(基地)科技成果推广专项(TGZX2015-46)
【所属期刊栏目】华北农学报
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