苹果Hsf家族成员的序列特征、表达与进化分析
2017-04-28分类号:S661.1
【部门】新乡医学院基础医学院 河南师范大学生命科学学院 漯河职业技术学院食品工程系
【摘要】为全面了解苹果基因组中热激转录因子(Hsf)的序列特征及进化,采用生物信息学手段,在苹果全基因组水平上鉴定出50个MdHsf基因,并对其系统发育关系、序列特征、表达情况以及选择压力进行详细分析。系统发育与序列分析显示:与拟南芥和水稻相似,50个MdHsf基因可分为A、B、C 3个亚族;2个或多个MdHsf基因位于同一个末端进化支,说明该基因家族在苹果中发生了物种特异性扩增;尽管MdHsf基因的内含子数目和长度变异较大,但其蛋白的保守基序和功能结构域具有较高的保守性,这可能与功能约束有关。基于EST数目,可
【关键词】苹果 热激转录因子 表达 进化
【基金】国家自然科学基金项目(31300202;31470334)
【所属期刊栏目】华北农学报
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