烟台黑猪SLA-DRA基因编码区多态性及生物信息学分析
2017-02-28分类号：S828
【部门】甘肃农业大学动物科学技术学院 河南省漯河市畜牧局 甘肃省现代养猪工程技术研究中心
【摘要】为了探究烟台黑猪SLA-DRA基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对SLA-DRA基因4个外显子的多态性、蛋白质的理化性质、结构域、蛋白质的空间结构和功能进行了预测和分析。结果显示:SLA-DRA基因exon 1、exon 2和exon 4共检测到11个SNPs,导致7个氨基酸发生变异,exon 3没有突变产生,exon 4的多态性最丰富。SLA-DRA基因编码区759 bp核苷酸共编码252个氨基酸和1个终止子。SLA-DRA基因蛋白质是一种偏酸
【关键词】SLA-DRA基因 烟台黑猪 编码区 多态性 蛋白质结构 分子进化树
【基金】甘肃省农牧厅生物技术专项(GNSW-2008-04);; 甘肃省科技重大专项(092NKDA036);; 甘肃省科技支撑计划项目(0804NKCA065);; 国家自然基金项目(31660646)
【所属期刊栏目】华北农学报
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