基于MiSeq分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及群落结构
2017-06-25分类号：S827
【部门】四川农业大学动物医学院 动物疫病与人类健康四川省重点实验室 环境公害与动物疾病四川省高校重点实验室
【摘要】采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对细菌16S rDNA序列V4区进行MiSeq测序。结果显示:1)从样品A与样品F中共获得高质量序列338 830条,聚类后得3 400个运算分类单位(OTU);2)样品A的α多样性指数高于样品F的,但其差异无统计学意义;3)门水平上,样品A最高相对丰
【关键词】川中黑山羊 瘤胃细菌 多样性 群落结构 Mi Seq测序 拟杆菌门 普雷沃氏菌属
【基金】“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目(IRT0848);; 四川农业大学“双支”计划项目(03572070)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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