大口黑鲈EST-SNP标记开发及其与生长性状的相关性分析
2018-01-15分类号：S917.4
【部门】中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】为探讨EST-SNP标记的有效性及其与大口黑鲈(Micropterus salmoides)生长性状间的相关性,本研究采用RNA-seq技术进行大口黑鲈生长快个体和生长慢个体肌肉组织的转录组分析,分别检测到15 273和17 376个EST-SNP标记。采用Sna Pshot技术对其中75个EST-SNP标记在大口黑鲈生长性状极端群体中的EST-SNP进行多态性检测,结果显示有37个EST-SNP标记具有多态性,准确性为49.3%。进一步采用一般线性模型分析37个EST-SNP标记与大口黑鲈生长性状的相关
【关键词】大口黑鲈 转录组 SNP 遗传多样性 关联分析
【基金】广东省科技计划项目(2016A020210020;2015A020209035);; 渔港建设和渔业产业发展专项(A201601A12);; 浙江省农业(水产)新品种选育重大科技专项(2016C02055-3)
【所属期刊栏目】海洋渔业
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