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茶条槭SDH基因克隆及生物信息学分析

2017-01-10分类号:S792.35

【作者】崔丽婷  李文彦  包横  詹亚光  齐凤慧  
【部门】东北林业大学生命科学学院  
【摘要】结合茶条槭转录组数据库,利用RT-PCR的方法克隆得到茶条槭SDH基因,命名为AgSDH,并对该基因及其蛋白进行了生物信息学分析。结果显示,AgSDH基因的ORF全长为1 563 bp,共编码520个氨基酸,推测蛋白相对分子量为57.219 k Da,理论等电点为5.61,无信号肽,预测亚细胞定位于细胞质中。生物信息学分析表明AgSDH蛋白为亲水性蛋白,没有跨膜结构。蛋白质二级结构α-螺旋占35.38%,延伸链占18.65%,无规则卷曲占45.96%;三级结构预测表明AgSDH蛋白以单体形式存在。与目前已
【关键词】茶条槭  SDH  生物信息学分析  表达载体构建
【基金】中央高校基本科研经费“茶条槭次生代谢合成途径调控基因表达谱分析”(DL13CA07);; 哈尔滨市青年科技创新项目“诱导子作用下茶条槭细胞次生代谢途径关键酶基因表达研究”(2013RFQXJ026)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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