应用高通量测序技术分析拟穴青蟹肠道及其养殖环境菌群结构
2017-11-15分类号：S917.4
【部门】广西壮族自治区海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室
【摘要】采用基于Illumina Hi Seq测序平台的高通量测序技术,对拟穴青蟹(Scylla paramamosain)肠道及其养殖池塘水体、底泥中细菌种类及丰度进行了研究。测序结果显示,3个样品共获得有效序列234575条,可聚类于2812个分类操作单元(OTUs),归属于拟穴青蟹肠道、养殖水体、池塘底泥样品的操作分类单元(OTU)个数分别为453、706和2547,其中有184个OTU均能在3个样品中检测到,在青蟹肠道和养殖水体、青蟹肠道和池塘底泥中分别检测到197和309个共有OTU。物种注释结果显示,
【关键词】拟穴青蟹 肠道 养殖水体 底泥 菌群结构 高通量测序 微生态调控
【基金】广西科技开发项目(桂科合1599005-2-18;桂科能1598020-10;桂科AB16380105;桂科合14125008-2-20)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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