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甘蓝型油菜种子和角果皮中硫苷含量的动态变化及转录组关联分析

2018-03-02分类号:S565.4

【作者】田志涛  赵永国  LENKA Havlickova  HE Zhesi  REA L Harper  IAN Bancroft  邹锡玲  张学昆  陆光远  
【部门】中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点实验室  CNAP   University of York  
【摘要】【目的】探索甘蓝型油菜不同发育时期种子和角果皮硫苷含量的动态变化规律,通过转录组关联分析解析控制硫苷含量变异的遗传机制。【方法】在由113个油菜品种构成的自然群体中,利用高效液相色谱法检测不同发育时期油菜种子及角果皮中的硫苷含量。提取油菜幼嫩叶片m RNA并进行m RNA-Seq测序,开发了355 536个单核苷酸多态性标记(SNP)和116 098个基因表达量标记(GEM)。将开发的SNPs和GEMs分别导入到混合线性模型(MLM)和回归分析模型中进行关联分析,获得与油菜硫苷表型变异显著相关的遗传位点,
【关键词】甘蓝型油菜  硫代葡萄糖苷  动态变化  转录组关联分析  单核苷酸多态性标记  基因表达量标记
【基金】国家自然科学基金(31371663)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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