贵紫麦1号籽粒色素形成相关基因的差异表达
2018-01-20分类号:S512.1
【部门】贵州大学农学院/国家小麦改良中心贵州分中心
【摘要】【目的】探明贵紫麦1号小麦灌浆期变紫后和变紫前2个时期籽粒的转录组差异,发掘影响贵紫麦1号花青素合成的关键基因和关键酶,丰富小麦籽粒色素转录组数据信息,为转录因子的克隆及表达提供参考。【方法】利用Illumina Hiseq 2000TM高通量测序技术对贵紫麦1号籽粒变紫前和变紫后2个时期进行转录组测序、文库构建及建库质量评估,对测序结果进行信息学分析。采用TTM对read count数据进行标准化处理,随后用DEGseq进行差异分析,设定q-value1为阈值。通过筛选分析,获得两者间差异表达基因,按照
【关键词】贵紫麦1号 籽粒 灌浆期 花青素 转录组 高通量测序
【基金】国家自然科学基金(31660390);; 贵州省农业成果转化计划(黔科合成果(2016)4022号);; 国家“七大农作物育种”重点专项(2017YFD0100900);; 贵州省作物学省级重点学科建设计划(黔学位合字ZDXK[2014]8号);; 贵州省普通高等学校粮油作物遗传改良与生理生态特色重点实验室项目(黔教合KY字[2015]333)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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