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用高基元微卫星标记分析中国糜子遗传多样性

2017-10-26分类号:S516

【作者】王瑞云  刘笑瑜  王海岗  陆平  刘敏轩  陈凌  乔治军  
【部门】山西农业大学农学院  山西省农业科学院农作物品种资源研究所/农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室  中国农业科学院作物科学研究所  
【摘要】【目的】开发高基元(4—6)碱基重复微卫星标记,分析种质资源遗传多样性,为糜子遗传和进化研究提供理论基础。【方法】用隶属函数、主成分分析和聚类分析综合评价糜子资源表型多样性,用前期糜子转录组测序获得高基元SSR引物对地理来源差异大的糜子材料进行PCR扩增检测其多态性,用Power Marker 3.25计算遗传多样性参数,用Pop Gen 1.32计算Nei’s遗传距离,用MEGA 5.0进行聚类分析,用Structure 2.2鉴定遗传类群。【结果】96份糜子资源株高和穗长变异最丰富,多样性指数分别为2
【关键词】糜子  高基元SSR  遗传多样性  聚类分析  遗传结构
【基金】国家自然科学基金(31271791);; 山西省回国留学人员科研资助项目(2016-066);; 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-06-13.5-A16);; 山西省重点研发计划(一般项目)(农业)项目(201603D221003-5)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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