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基于转录组信息的黑果枸杞MYB转录因子家族分析

2017-10-26分类号:Q943.2;S567.19

【作者】严莉  王翠平  陈建伟  乔改霞  李健  
【部门】宁夏大学生命科学学院  宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室  
【摘要】【目的】MYB基因家族是植物中最大的一类转录因子家族,广泛参与植物的生长发育和代谢调控过程。目前仍没有针对枸杞等木本作物MYB转录因子家族的系统分析。基于转录组数据鉴定分析黑果枸杞MYB基因家族,可为该类基因生物学功能和代谢调控机制的研究提供参考。【方法】基于黑果枸杞转录组测序(RNA-Seq)数据,利用NR、NT、Swiss-Prot和PFAM 4个数据库和NCBI网站,对黑果枸杞MYB基因进行筛选注释;利用Web Logo3、Prot Comp 9.0、MEGA5.0软件进行保守结构域、亚细胞定位和系
【关键词】黑果枸杞  转录组测序  MYB家族  分层聚类分析  表达模式
【基金】国家自然科学基金(31660045);; 国家国际科技合作专项(2015DFA90900);; 宁夏自然科学基金(NZ16215)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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