甜菜WRKY转录因子全基因组鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析
2017-09-05分类号：Q943.2;S566.3
【部门】华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室 石河子大学农学院/新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室
【摘要】【目的】WRKY转录因子是一类植物响应生物、非生物胁迫,对生长发育都起重要调控作用的转录因子。在甜菜全基因组信息分析的基础上,鉴定WRKY家族基因(Bv WRKYs),解析其组织特异性及盐、热胁迫下的表达情况,为该类基因的功能研究提供参考,为观赏甜菜和石竹目其他观赏植物的基因工程打下基础。【方法】以75条拟南芥WRKY蛋白为参考,根据WRKY保守蛋白序列(PF03106)利用hmm和BLAST同源性搜索对甜菜WRKY家族基因进行鉴定。利用Map Inspect、GSDS2.0、MEGA5.0、DNAMAN
【关键词】甜菜 WRKY转录因子 生物信息学 胁迫 表达分析
【基金】国家自然科学基金(31000918);; 中央高校基本科研业务费专项(2662015PY052,2662016PY041)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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