匍匐翦股颖接种立枯丝核菌后基因表达变化的转录组学分析
2017-09-05分类号：S436.8
【部门】甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心
【摘要】【目的】确定匍匐翦股颖(Agrostis stolonifera)接种立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)后基因种类和表达量在转录水平的变化规律,明确草坪草病原菌侵染响应的关键基因。【方法】匍匐翦股颖生长14 d后采用麦粒培养物接种立枯丝核菌,接种3 d后选取感病叶片和未接种叶片提取RNA,进行转录组高通量测序,然后利用生物信息学分析,用Trinity组装匍匐翦股颖转录组,以组装子为参考,以|log2(fold change)|>1,q-value
【关键词】匍匐翦股颖 立枯丝核菌 转录组 差异表达基因 抗病机制
【基金】国家自然科学基金(31360583)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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