白菜类作物开花时间的全基因组关联分析
2017-09-05分类号:S634
【部门】中国农业科学院蔬菜花卉研究所 云南省农业科学院园艺作物研究所
【摘要】【目的】解析白菜类作物开花时间的调控位点,定位白菜类作物开花时间相关的候选基因,为白菜类作物抽薹开花时间的遗传改良提供依据。【方法】以116份白菜类作物组成的自然群体作为研究材料,分别种植在温室与露地2个独立的环境中,进行开花时间调查。同时,提取试验材料的DNA样品进行深度为1.2x的重测序,对测序数据用Pooled Mapping法进行过滤、与参考基因组比对,获得全基因组高密度SNP集合。经过条件过滤后,对高质量的SNP集合进行生物信息分析,包括试验材料的群体结构分析和全基因组连锁不平衡分析。从高质量的
【关键词】白菜类作物 开花时间 连锁不平衡 全基因组关联分析 候选基因
【基金】国家自然科学基金(31272179)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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