【摘要】基于福建省、台湾地区2016年41家农民专业合作社、农会、农业合作社的调查数据,运用三阶段DEA方法,测度了海峡两岸农业经济合作组织效率。研究发现,海峡两岸农业经济合作组织技术效率水平偏低,规模效率不高是导致技术效率偏低的主要原因;外部环境因素对农业经济合作组织技术效率影响较大,但环境因素的影响程度、方向有所不同;两岸农业经济合作组织效率差距较大,大陆地区农业合作社在规模、管理水平、技术水平等方面同台湾地区有较大差距;两岸农业经济合作组织均处于规模报酬递增阶段,可适度扩张规模提升运营效率。