【摘要】R&D投资效率问题是学界普遍关心的话题,但对融资约束及其后续不确定性如何影响R&D投资效率关注不足。以异质性随机前沿函数为基础,实施研究发现,由于受融资约束的影响,中国非上市规模以上制造业平均投资效率为59%左右,比最优效率低了40%左右;制造业R&D投资主要来源于内源融资,外源融资中的银行贷款不是主要融资渠道;内源融资中的自有现金流虽可以缓解融资约束,但会增加不确定性;银行贷款不能缓解融资约束但可以降低不确定性;商誉融资既可以降低融资约束,又不会增加不确定性;小规模公司和西部地区受到的融资约束更严重。需要进一步的金融发展与改革,提高企业盈利能力,增加内部现金流以解决企业R&D投资中的融资约束问题。